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适宜的土壤微生物环境是烟草优质适产的必要条件，古菌对土壤生态系统碳氮循环起着非常重要作用。本研究采用定点田间试验的方法，研究了磷肥和生物有机肥连续三年配施对新整理黄壤烟田烤烟产质量与烟田古菌群落结构的影响。结果表明，新整理黄壤烟田土壤古菌群落主要由奇古菌门、广古菌门和未分类古菌门这三个菌门组成，其中奇古菌门的古菌数量较多；连续三年施用生物有机肥土壤古菌群落多样性提高，菌属种类增加7～13个，76．5％的菌属相对丰度高于传统施肥，施用生物有机肥的处理各菌门分布更为均匀，这有利于烟田土壤微生物生态系统趋于稳定