【摘 要】
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为明确乌头属药用植物密码子使用特征及其系统发育关系。本研究以乌头属9种药用植物叶绿体基因组为材料，采用分析软件CondoW，在线软件CUSP，R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析，同时采用MAFFT软件，MEGA软件进行系统发育分析。结果显示，乌头属9种植物密码子偏好性形成主要受自然选择影响，乌头属9种植物叶绿体基因组高频密码子和最优密码子偏好相同，偏向于A/U结尾。9种植物共有13个最优密码子，
【基金项目】
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内蒙古自然科学基金半寄生植物百蕊草种子休眠关键基因筛选（2019MS03052）； 内蒙古自治区高校中(蒙)药材生态种植工程研究中心(培育)项目共同资助；
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为明确乌头属药用植物密码子使用特征及其系统发育关系。本研究以乌头属9种药用植物叶绿体基因组为材料，采用分析软件CondoW，在线软件CUSP，R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析，同时采用MAFFT软件，MEGA软件进行系统发育分析。结果显示，乌头属9种植物密码子偏好性形成主要受自然选择影响，乌头属9种植物叶绿体基因组高频密码子和最优密码子偏好相同，偏向于A/U结尾。9种植物共有13个最优密码子，叶绿体基因组CDS序列密码子第1位和第2位碱基组成相似，第3位碱基组成对密码子偏好影响较大。基于叶绿体全基因组和CDS序列构建的系统进化关系符合中国植物志亚属的分类关系，且二者都不支持狭盔高乌头作为高乌头的变种。本研究结果可以为乌头属植物的系统进化和遗传育种提供一些参考。
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