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自噬是一种在真核细胞内保守的降解过程，从单细胞的酵母到哺乳动物中都普遍存在。自噬通过降解细胞内受损的蛋白、细胞器、细胞质以及入侵的微生物等来维持机体的稳态。结合已有的文献报道和实验室的经验积累，总结了目前在细胞自噬研究中常用的一些研究方法：LC3 turnover、GFP的抗降解性、p62、mRFP-GFP-LC3活细胞成像、电镜和流式细胞仪检测等，以及在实验中需要注意的具体事项，如一些可以直接影响实验结果但并没有引起人们重视的因素。希望能为新进入细胞自噬领域的研究人员提供一些实验操作上的指导和参考，从而可以在自噬研究中得到真实准确及可重复的实验结果与合理的理论解释。