2019—2020年我国中南地区猪圆环病毒2型的分子流行病学研究

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为了探明2019—2020年我国中南地区猪场中猪圆环病毒2型(PCV2)的流行情况,本研究选择从该地区414个规模化猪场收集的1 707份疑似PCV2感染样本,通过荧光定量PCR方法进行PCV2的检测。随机选取我国中南7个省份的50份PCV2阳性样品ORF2基因进行PCR扩增。胶回收后连接载体转化,菌落培养,提取质粒鉴定后测序,利用MegAlign软件进行同源性分析,利用iTOL在线进行分子遗传进化分析。结果显示,1 707份样本中PCV2检出率为36.08%(616/1 707),414个猪场PCV2检出率为49.03%(203/414);不同样品中,肺脏检出为41.31%,胎儿检出率为34.51%,血样检出率为31.97%,精液检出率为4.12%。50株PCV2之间的ORF2核酸序列同源性为84.1%~100%,与18个参考序列的核苷酸序列同源性为75.6%~99.8%。遗传进化分析显示PCV2d占80%(40/50),PCV2a占4%(2/50),PCV2b占16%(8/50),未检测到PCV2c和PCV2e,其中PCV2d为河南、湖北、湖南、四川、山东、云南、广东等省份的主要基因型。结果表明,2019—2020年我国中南地区PCV2的主要流行基因型是PCV2d,其次为PCV2a和PCV2b。该研究为PCV2疫苗的研发和临床防控提供了理论依据。
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