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目的
分析一起食源性疾病事件中病原的基因组学特征。
方法选取事件中死亡病例血样和洗胃前胃内容物，以及其就餐食物作为样品，共11份，对金黄色葡萄球菌和蜡样芽胞杆菌以及有毒物质进行检测，并对食物中检测到的细菌进行计数。采用实时荧光PCR方法检测分离得到的10株蜡样芽胞杆菌的16 S rDNA保守区基因和呕吐毒素ces基因，并采用二代测序技术对分离株进行了基因组测序，初步分析质粒携带情况，并与公共数据库中参考序列进行比较基因组学分析。
结果所有样品中，仅蜡样芽胞杆菌检测阳性，其中蛋炒饭中蜡样芽胞杆菌计数为1.9×107 CFU/g，干炸鱼和卤猪头肉中均为3.0×103 CFU/g。10株分离株均携带hlyⅢ、nheA、nheB、inlA、inhA毒力基因；携带plcR和nheC基因的菌株均为9株。分离株16 S rDNA保守区基因和ces基因均为阳性，而且均携带完整的ces基因簇序列，并且与分离自英国的AH187株携带的呕吐毒素质粒pCER270(NC_010924.1)和分离自日本的NC7401株携带的质粒pNCcld(NC_016792.1)的序列完全一致。质粒比对结果显示，分离株序列与炭疽杆菌的pXO1和pXO2质粒差异较大，但携带含ces基因的pNCCld质粒。10株分离株基因组系统发生树显示，10株蜡样芽胞杆菌高度相似（系统发生树上距离为2.0×10-6~9.0×10-6）且与AH187株和NC7401株均高度相似（均属ST26型，系统发生树上距离均为3.8×10-5~4.5×10-5）。
结论本次食源性疾病事件由不携带pXO1、pXO2质粒的呕吐型蜡样芽胞杆菌污染蛋炒饭引起。提示蜡样芽胞杆菌引起呕吐型食物中毒可能与携带ces基因的ST26、ST164等型别菌株相关。