【摘 要】
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高体鳑鲏(Rhodeus ocellatus)色彩艳丽、体型优美,是一种很有市场前景的观赏鱼.对高体鳑鲏线粒体基因组(mitochondrial genome,mtGenome)进行测序和分析、探讨不同地理群体高
【机 构】
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杭州市农业科学研究院 水产研究所,杭州310024;丽水市水产技术推广总站,丽水323000
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高体鳑鲏(Rhodeus ocellatus)色彩艳丽、体型优美,是一种很有市场前景的观赏鱼.对高体鳑鲏线粒体基因组(mitochondrial genome,mtGenome)进行测序和分析、探讨不同地理群体高体鳑鲏的mtGenome差异以及高体鳑鲏在鱊亚科的系统发育地位,有利于高体鳑鲏的系统发育研究.本研究通过PCR扩增、测序、软件拼接等方法获得瓯江高体鳑鲏mtGenome(GenBank No.MW007386),长度为16 675 bp,碱基组成为 A(28.98％)、G(17.09％)、C(26.51％)和 T(27.42％),包含 13个蛋白编码基因(protein-coding genes,PCGs)、22个tRNAs和2个rRNAs.瓯江高体鳑鲏mtGenome 与 PCGs 的(A+T)含量分别为56.41％和56.27％,均具有明显的AT偏好性.在22个tRNAs中,除tRNA-Ser(AGY)外均可形成典型的三叶草结构.基于BLAST的比较表明,瓯江高体鳑鲏与东江高体鳑鲏的序列一致性为83.84％,与日本高体鳑鲏的序列一致性为95.07％,与GenBank No.DQ026430的高体鳑鲏序列一致性为93.11％,与图们江兴凯鱊(Acanthorhodeus chankaensis)序列一致性为99.03％,与黑龙江兴凯鱊序列一致性为83.72％,与沅江兴凯鱊序列一致性为83.84％.另外,瓯江高体鳑鲏与图们江兴凯鱊之间的遗传距离最近,与日本高体鳑鲏遗传距离次之,与东江高体鳑鲏则较远.基于25种隶属于3个属的鱊亚科鱼类mtGenome构建的系统进化树分析表明,瓯江高体鳑鲏与图们江兴凯鱊亲缘关系较近,而与东江高体鳑鲏亲缘关系较远.本研究为瓯江高体鳑鲏的遗传多样性保护与育种提供了参考依据.
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