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[目的]研究29个中国银杏雄株材料的亲缘关系，以期为该树种雄株的分类、保存、利用等提供理论依据。[方法]从64对EcaR Ⅰ／Mse Ⅰ引物（其中MseⅠ引物为荧光标记物）中筛选出7对清晰、多态性高的引物，对来自中国的29个银杏雄株材料的亲缘关系进行了AFLP分析。[结果]7对引物共产生1173条谱带，187个特异位点和1145条多态带，多态带的比例平均为97．6％。每对引物鉴别效率达到100％。所有材料之间相似系数在0.38～0．82之间，供试材料遗传变异大。当相似系数为0．51，将全部试材可以分为2大