猪型流感病毒血凝素基因的核苷酸全序列分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lilinli2
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对我国大陆首次从猪群中分离到的猪型(H1N1)流感病毒血凝素(HA)基因核苷酸全序列进行了测定,其长度为1778bp,共编码566个氨基酸,其中信号区17个,HA1区326个,多肽连接区1个,HA2区222个。与A/NJ/11/76(H1N1)毒株HA蛋白分子上氨基酸序列相比,其同源性为94.5%,而HA1和HA2区的同源性分别为93.6%和97.7%。同时在HA1区的第276个位点上多1个糖基化点,然而其余的包括2个重叠的糖基化点均相同。 The complete nucleotide sequence of the hemagglutinin (HA) gene of porcine swine influenza virus (H1N1) was isolated from pig herds for the first time in China. The length of the HA gene was 1778bp, encoding a total of 566 amino acids, of which 17 326 in the HA1 region, 1 in the polypeptide linker region and 222 in the HA2 region. Compared with the amino acid sequence of HA protein of A / NJ / 11/76 (H1N1), the homology was 94.5%, while the homologies of HA1 and HA2 were 93.6% and 97, respectively. 7%. At the same time, more glycosylation sites are located at the 276th site in the HA1 region, while the remaining sites including the two overlapping glycosylation sites are the same.
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