【摘 要】
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目的 筛选影响肺癌和结直肠癌放疗敏感性的相关基因及其通路,为患者实现精准放疗提供理论依据。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中筛选出肺癌和结直肠癌放疗患者,根据生存期是否超过3年分成两组,进而利用limma软件分析两组患者之间差异表达基因,筛选P1.5或FC<0.67的基因并对其进行GO功能注释和KEGG富集、筛选差异表达基因,Kaplan-Meier plotter分析差异表达基因总体生存
【机 构】
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海军军医大学海军医学系舰船辐射医学防护教研室
【基金项目】
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上海市卫健委项目(20214Y0012); 海军军医大学海狼军事医学课题(HL20JD2509);
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目的 筛选影响肺癌和结直肠癌放疗敏感性的相关基因及其通路,为患者实现精准放疗提供理论依据。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中筛选出肺癌和结直肠癌放疗患者,根据生存期是否超过3年分成两组,进而利用limma软件分析两组患者之间差异表达基因,筛选P1.5或FC<0.67的基因并对其进行GO功能注释和KEGG富集、筛选差异表达基因,Kaplan-Meier plotter分析差异表达基因总体生存率。结果 从TCGA数据库中筛选出269个上调基因和211个下调基因。其中差异表达基因主要涉及细胞因子细胞因子受体相互作用、Wnt信号通路、细胞色素P450对外来生物代谢的影响等生物过程。主要富集在上皮细胞增殖、细胞细胞黏附的调节、体液免疫反应、对外界刺激反应的积极调节等功能方面。与生存期小于3年的患者相比,SFTPB(P=0.000 11)、SFTPA2(P<0.000 1)基因低表达的患者生存曲线明显较好,而OLFM4(P=0.000 11)、LGALS4(P<0.000 1)高表达的患者有更好的生存率。结论 SFTPB、SFTPA2、OLFM4和LGALS4可能是影响肺癌和结直肠癌放疗敏感的关键基因。
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