【摘 要】
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目的 通过基因表达综合（GEO）数据库对进行性核上性麻痹（PSP）相关基因芯片进行生物信息学分析，获得PSP的生物标志物及其调控的关键通路。方法 从GEO2R分析工具获取PSP相关基因芯片的基因表达数据集GSE6613,筛选出差异表达基因（DEGs）,并借助DAVID在线分析平台对这些基因进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路分析。利用生物信息学软件STRIN
【基金项目】
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上海市奉贤区科技发展基金项目（20201428）；
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目的 通过基因表达综合（GEO）数据库对进行性核上性麻痹（PSP）相关基因芯片进行生物信息学分析，获得PSP的生物标志物及其调控的关键通路。方法 从GEO2R分析工具获取PSP相关基因芯片的基因表达数据集GSE6613,筛选出差异表达基因（DEGs）,并借助DAVID在线分析平台对这些基因进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路分析。利用生物信息学软件STRING构建这些基因的蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络，找出连接度最高的核心基因。临床标本验证：选取2016年1月至2021年12月收治的9例PSP患者作为试验组，选取2022年1月至2022年2月行常规查体的非PSP患者作为对照组，留取上述人群血液标本并提取总RNA,实时荧光定量PCR检测生物信息学分析得出的DEGs及PPI网络中的核心基因表达水平。结果 该研究中所采用的GSE6613数据集共包含6例PSP患者及23例健康者。共筛选出DEGs 98个，包括52个上调基因及46个下调基因。其中，差异最大的5个上调基因依次为MYOM2、EMP1、DKK2、FBN1、POLA2;差异最大的5个下调基因依次IVD、TMED7、MSMO1、CASP3和DLG1。GO和KEGG结果表明，PSP发展过程中的DEGs主要富集在炎症、免疫紊乱、代谢紊乱等方面。PPI网络揭示连接度最高的核心基因为KRAS。临床标本验证显示，与对照组比较，试验组EMP1和DKK2基因表达上调，DLG1和KRAS基因表达下调，差异均有统计学意义（P＜0.05）。结论 PSP患者的DEGs与炎症、免疫紊乱及能量代谢密切相关，EMP1、DKK2和DLG1基因有望成为PSP诊断的分子标志物，核心基因KRAS有望成为PSP潜在治疗靶点。
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