【摘 要】
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目的利用生物信息学方法探寻ER阴性乳腺癌关键基因及潜在治疗药物。方法利用GEO数据库下载乳腺癌基因表达谱(GSE22219)。应用R语言对GSE22219进行主成分分析(PCA)、差异表达基因(DEGs)和基因本体(GO)分析。使用STRING进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)路径分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。用Cytoscape软件进行可视化编辑,MCODE插件进行子网络模块分析,筛选出ER阴性乳腺癌发生过程中的核心基因。利用Drugbank探寻小分子化合物作为潜在的治疗药物。结果筛
【机 构】
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西安交通大学第一附属医院肿瘤放疗科,西安交通大学第一附属医院儿科
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目的利用生物信息学方法探寻ER阴性乳腺癌关键基因及潜在治疗药物。方法利用GEO数据库下载乳腺癌基因表达谱(GSE22219)。应用R语言对GSE22219进行主成分分析(PCA)、差异表达基因(DEGs)和基因本体(GO)分析。使用STRING进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)路径分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。用Cytoscape软件进行可视化编辑,MCODE插件进行子网络模块分析,筛选出ER阴性乳腺癌发生过程中的核心基因。利用Drugbank探寻小分子化合物作为潜在的治疗药物。结果筛
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