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采用RAPD技术对内蒙古草原5个具较大地理跨度的小叶锦鸡儿（Caragana microphylla）地理群的遗传多样性和遗传结构特点进行了研究。共检测到466个位点，多态位点463个，多态位点百分率（PPB）为99．36％；特有位点37个，占7．94％。Nei指数和Shannon指数都表明阿巴嘎旗小叶锦鸡儿地理群遗传多样性最高，其它地理群的遗传多样性有向东、向西降低的趋势。AMOVA得到的固定系数φst为0．05526；基因分化系数Gst为0．0673，用Shannon指数估算的地理群间变异比率（Hsp