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口蹄疫病毒的转译起始由一基因组内的顺式作用元件被称为内部核糖进入位点（IRES）所介导．FMDV的IRES的二级结构、三级结构以及它们之间的相互作用，是维持其转译活性所必需的．在这个转译过程中。EIF4G，EIF4B，EIF4A协同的结合到IRES的3’区域，然后小核糖体亚单位、大核糖体亚单位结合到连有起始因子的IRES复合物上，核糖体在小RNA的IRES上得到组装，转译开始。