目的研究近几年影响新生儿先天畸形的相关因素。方法随机选取2011年~2015年中国人民解放军第三军医大学第三附属医院收治的新生儿401例,分为对照组与观察组。对照组200例,健康新生儿。观察组201例,先天畸形新生儿。统计观察组新生儿先天畸形类型、比较2组新生儿单因素分析结果及观察组先天畸形相关因素Logistic回归性分析结果。结果观察组新生儿先天畸形类型有肢体短缺畸形、腹裂、消化系统畸形、先天性心脏病、21-三体综合征、颅面部畸形6种类型,其中先天性心脏病患儿77例(38.31%),肢体短缺畸形患儿50例(24.88%),颅面部畸形患儿31例(15.42%),其中先天畸形高危因素为妊娠合并症、吸烟酗酒、父亲慢性病、病毒感染、用药,保护因素为定期体检。结论影响新生儿先天畸形的相关因素有妊娠合并症、吸烟酗酒、父亲慢性病、病毒感染、用药,孕产妇应定期体检,养成良好的生活习惯,以降低先天畸形新生儿的出生率。