基于生信分析筛选胆囊癌关键基因及相关通路的研究

来源 :中国肿瘤外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wagegea

【摘要】

：

目的通过生信分析筛选胆囊癌治疗的关键基因及癌症相关通路,挖掘胆囊癌患者的差异基因,预测胆囊癌的潜在治疗靶点。方法对GEO数据库中获得的芯片数据进行差异基因(DEGs)分析

【作者】

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殷晓晓薛小峰赵华

【机构】

：

苏州大学附属第一医院普外科

【出处】

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中国肿瘤外科杂志

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

胆囊癌生物信息学分析差异基因靶点 Gallbladder cancer Bioinformatics analysis Differential gene

【基金项目】

：

江苏省自然科学基金(BK20130268)

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目的通过生信分析筛选胆囊癌治疗的关键基因及癌症相关通路,挖掘胆囊癌患者的差异基因,预测胆囊癌的潜在治疗靶点。方法对GEO数据库中获得的芯片数据进行差异基因(DEGs)分析。选取NCBI-基因表达综合数据库(GEO)中的基因表达芯片“GSE76633”和“GSE74048”,利用GEO2R在线分析工具对胆囊癌样本和正常胆囊样本中的差异基因进行筛选。在DAVID和KOBAS上对差异基因进行生物过程(GO)分析和通路富集(KEGG)分析。使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析数据库STRING构建靶点互作(P

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