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以江西省普通公办本科高校为样本，运用DEA方法对这些高校科研效率进行分析发现，整体来看，江西公办本科高校的科研效率水平不够理想；江西公办本科高校科研的技术效率比综合效率和规模效率的情况要好，并且，在非DEA有效的决策单元中，技术效率普遍高于综合效率；规模效率则同综合效率的变化同步，导致6所高校规模效率非DEA有效的原因存在一定的差异。据此，应通过加强人才队伍建设，提高科研人员整体学术水平；完善激励制度，激发科研人员热情；合理配置科研经费项目资源和构建分层次、多方位竞争机制等措施提高高校科研效率。