脊椎动物基因注释中的大基因问题

来源 :世界科技研究与发展 | 被引量 : 0次 | 上传用户：redhatping

【摘要】

：

为了找出编码蛋白质的基因,注释流程结合了"从头开始的基因预测方法"和"与已知基因相似性比较"这两种方法."从头开始的基因预测方法"虽然有很高的假阳性但是假阴性却很低;相

【作者】

：

王俊李胜霆张勇郑洪坤徐昭叶葭于军黄家树

【机构】

：

中国科学院北京基因组研究所,中国科学院北京基因组研究所,中国科学院北京基因组研究所

【出处】

：

世界科技研究与发展

【发表日期】

：

2003年6期

【关键词】

：

脊椎动物基因注释编码蛋白质假阳性假阴性基因预测大基因 gene prediction false positive false negativ

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为了找出编码蛋白质的基因,注释流程结合了"从头开始的基因预测方法"和"与已知基因相似性比较"这两种方法."从头开始的基因预测方法"虽然有很高的假阳性但是假阴性却很低;相形之下,结合了相似性比对的方法之后虽然能够降低假阳性,但是却大大提高了假阴性.我们发现,在这当中与基因预测正确率相关的最重要因素就是基因大小(包括内含子在内)--大基因尤其容易产生预测错误.

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