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以橡胶树品种热研88-13为试材,研究了橡胶树SAM-SSR法中各个过程(酶切、连接、抑制性和预扩增)中各因素对SAM法结果的影响。实验结果表明:5UMseⅠ和5UPstⅠ双酶切1h为最合适酶切浓度、方式和时间;100~300ng为适宜的DNA模板浓度;合适的连接温度和时间为16℃连接过夜;连接产物和抑制性PCR产物分别稀释20倍,为抑制性PCR和预扩增PCR的适宜模板浓度。SAM扩增产物用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测,结果显示,扩增条带分布在200~750bp之间,能够满足建立橡胶树SSR基因组文库的