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2019年底新型冠状病毒肺炎疫情暴发,国家紧急医学救援队收到命令后24 h内携功能方舱集结武汉,整建制入驻并联合启动方舱医院,规范预检分诊、查房巡诊、出入院及转诊流程、核酸检测、CT复查等,理顺方舱运行秩序后交予后续地方医疗队接管,国家紧急医学救援队配置模块化,操作规范化,行动机动迅速,能在短时间内启动方舱医院并有序运行,在抗击新型冠状病毒肺炎疫情中起到早期有效隔离、分类收治的作用,有效控制传染源,切断传播途径,为后续地方医疗队的大规模援助争取时间、提供经验,为整个抗疫工作做出了重大贡献。