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目的探讨永新县城镇居民医保中参保儿童（以下简称参保儿童），与新型农村合作医疗中参合儿童（以下简称参合儿童）的呼吸系统疾病住院医疗费用差异及其影响因素。方法选取我县2016年5月-10月参保儿童和参合儿童呼吸系统疾病住院患儿850例，对住院医疗费用的差异性及其影响因素进行分析。结果参保儿童的平均住院医疗费用要高明显高于参合儿童，差异具有统计学意54（P〈0.05）。其中药物费用和统筹支付费用在住院医疗费用中占据着很高的比例；住院时间、医院等级以及家庭收入水平是影响住院医疗费用差异的主要因素。结论针对影响城乡