C型乙型肝炎病毒的全基因组序列分析

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【摘要】

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目的探索乙型肝炎病毒(HBV)全基因组的结构特点.方法应用直接PCR基因分型法确定HBV基因型,然后随机选择1例单纯HBV C基因型感染的患者血清,分3个相互重叠片段扩增HBV基因并分

【作者】

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董庆鸣何忠平庄辉宋淑静戴旺苏

【机构】

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北京地坛医院病毒研究室,北京大学医学部病原生物学系

【出处】

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中国公共卫生

【发表日期】

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2003年11期

【关键词】

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C型乙型肝炎病毒 HBV 基因型基本核心启动子变异全基因组序列分析 hepatitis B virus (HBV) genotype basic core

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目的探索乙型肝炎病毒(HBV)全基因组的结构特点.方法应用直接PCR基因分型法确定HBV基因型,然后随机选择1例单纯HBV C基因型感染的患者血清,分3个相互重叠片段扩增HBV基因并分别克隆测序.利用Vector NTI Suite 7.0软件包、GeneDoc 2.6和TreeView 1.5,将该3个基因片段拼接为全基因组序列,命名为BDHB1,并进行基因进化树分析和同源性比较.结果 HBV C基因型序列全长为3215 bp,其中A占22.2%,G占22.4%,C占26.8%,T占28.6%;有S、C

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