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考虑在计算HI值时，任何一种碱基在序列中出现的理论频数都应该大于5，故而对原HI公式进行了约化处理，并将约化后的HI值与原HI值作了对比，发现不同的约化方式所得到的HI值在描述序列不均匀性时的效果是不同的，用编码区所偏好的约化语言进行约化后所得到的HI值在应用于高GC含量、中GC含量以及总共的外显子和内含子的识别时，其效果要优于原HI值。