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为了增强扩频系统的窄带干扰抑制能力，针对重叠域中值滤波（MF）算法会给信号带来失真的缺点，提出一种基于重叠变换域窄带干扰抑制算法。该算法基于直接序列扩频信号在重叠变换域的特点，利用阈值滤波、中值滤波、估计门限进行综合判决。仿真表明：该算法能有效降低信号干扰能量，同时减少中值滤波算法对信号造成的失真，增强了系统性能和鲁棒性。