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目的明确4起手足口病暴发疫情的病原体并对其进行基因特征分析。方法收集4起手足口病疫情部分病例的粪便，用RT—PCR的方法检测肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CA16），选择4个代表性样品进行VP1基因的扩增和核苷酸序列测定，测定结果利用DNAstar和Blast软件进行比对分析。结果4次手足口病疫情的样品CA16检测均为阳性，EV71检测均为阴性。4个代表株与标准株Tainan5079—98的VP1基因核苷酸同源性波动于95．2％-95．6％，4个毒株之间的核苷酸同源性波动于93．9％～9