为甘蔗改良中进一步利用抗逆性强的斑茅种质，本研究采用田间试验与DNA分子标记分析相结合的方法，对100个具有斑茅种质的甘蔗品系(斑茅BC<,1>品系)及其亲本的农艺性状和品质性状进行遗传多样性分析，同时采用单标记分析法检测对重要经济性状效应显著的分子标记。取得的结果如下： (1)对供试品系萌芽率、分蘖数、公顷有效茎数、茎长、茎径、单茎重和产量等7个主要农艺性状的分析，产量、分蘖数、公顷有效茎数和单茎重的遗传变异较大，茎径的遗传变异较小。 (2)对供试品系锤度、转光度、视纯度和纤维分等4个主要品质性状的分析，转光度、纤维分和锤度的遗传变异较大，视纯度的遗传变异较小。 (3)对104个供试品系进行16对AFLP引物和8对SSR引物的扩增，共获得1285个标记。其中AFLP标记1171个，包括多态性标记536个，多态率为45.77％，SSR标记114个，多态性标记58个，多态率为50.88％，因此，在这1285个标记中，多态性标记为共有594个，其中仅在母本YC96-40出现的标记280个，仅在父本CP84-1198出现的标记314个；在594个多态性标记中，筛选出单剂量(SD)标记199个。 (4)分子标记基因型聚类分析结果表明，104个供试品系分为2大类群，其中HN92-77(斑茅)独成一类；斑茅与甘蔗杂交及回交的后代均与栽培型甘蔗亲本同属另一大类群，包括7个子类群。其中最大类群为第6组，并在相似系数0.54范围内全部聚在一起；2个栽培型亲本(Badila和CP84-1198)及2个BC<,1>后代归于一个子类群。表明斑茅与栽培甘蔗之间遗传相似性低，亲缘关系较远。斑茅与甘蔗杂交及回交的后代，其基因型偏向于栽培型亲本。 (5)通过对SD标记与分蘖数、产量2个农艺性状和纤维分、锤度、转光度3个品质性状的相关性分析。表明父本CP84-1198对产量的遗传影响较大，父母本对分蘖数的遗传影响都具有影响；母本YC96-40对品质性状纤维分的遗传影响较大；而对锤度和转光度2个品质性状的遗传影响主要来自于父本CP84-1198。