基于多组学探讨HNRNPU在肝细胞癌中的表达及意义

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangxiang62
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的恶性消化系统肿瘤,是全球第六大恶性肿瘤,在全球肿瘤相关死亡因素中排名第四,其发病率和死亡率高,并且十分容易转移和复发。最新的全球癌症统计数据显示2018年全球范围内肝癌新发病例数为84.1万例,肝癌死亡病例数为78.2万例,其中几乎50%以上的发病例数和死亡病例数来自于我国。尽管过去十几年来已经识别了许多与HCC发生发展有关的基因,但HCC形成过程中的具体机制仍不明确,本研究通过对来自GEO数据库的HCC相关数据集进行的生物信息学分析,识别出与HCC发生显著相关的基因和通路,并在TCGA数据库中进行验证,随后进行细胞学实验探讨HCC形成的具体分子机制。方法:我们分析了来自GEO数据库的6个HCC相关数据集(GSE14520GPL571,GSE14520GPL3921,GSE41804GPL570,GSE45267GPL570,GSE60502GPL96、GSE6764GPL570),通过Meta分析和Pathway分析筛选出与HCC的发生发展密切相关的基因HNRNPU,进一步分析HNRNPU在HCC组织和正常组织中的表达差异,HNRNPU表达水平与HCC患者多种临床病理特征的关系以及HNRNPU表达水平预测HCC发生与否的能力。此外,还通过细胞学实验分析HNRNPU在HCC发生发展过程中的分子机制以及shHNRNPU对HCC细胞增殖的影响。结果:生物信息学分析结果提示HNRNPU的表述水平与肝细胞癌的发生发展相关,HNRNPU在肝细胞癌组织中的表达水平高于正常组织中的表达水平且差异有统计学意义(P1<0.001,P2<0.001,P3<0.001,P4<0.001,P5=0.001,P6<0.001),对TCGA数据集的分析也验证了这一结论(t=-7.232,P<0.001)。此外,使用固定效应模型对这6个微阵列数据进行Meta分析的结果同样表明HNRNPU在肝细胞癌组织中高表达,差异具有显著性(SMD=1.61;95%CI=1.43-1.78;P<0.001)。HNRNPU在低年龄组的表达水平显著高于高年龄组(t=3.216,P=0.001),在G3-G4组的表达水平显著高于G1-G2组(t=-5.701,P<0.001)。ROC曲线表明用HNRNPU表达水平预测HCC的发生与否有较高的诊断价值(AUC=0.796)。此外,本研究还发现HNRNPU可通过影响细胞周期、代谢、发育通路中相关基因的表达,从而影响HCC的发生发展。细胞学实验表明,敲低HNRNPU在SMMC7721和Huh7中的表达,能显著抑制HCC细胞的增殖(PHuh7=0.00016,PSMMC7721=0.00036)。结论:HNRNPU在肝细胞癌组织中显著高表达,HNRNPU表达水平与细胞增殖、HCC发生发展密切相关。本研究认为HNRNPU或许可作为生物标记物,为HCC的预防、早期诊断、治疗提供新的策略,提高患者生存率。
其他文献
【摘 要】 众所周知,高中数学本来就以抽象枯燥著称,在很大程度上是激发不了学生学习兴趣的,并且,大部分教师都喜欢采取以自身教学为主体,而忽略以学生为主体的“填鸭式”教育模式,因此造成了高中学生数学学习积极性的降低,创新性思维得不到提升。但随着新课改的推进,这种现象虽有所好转,却还存在不少问题,针对这些问题将在此做进一步解析。  【关键词】 高中数学;数学教学;学生;主体  【中图分类号】G63.2
研究了基于概念格(Concept LatticeCL)的序列模式挖掘方法,并给出了相应算法.与经典的算法比较,减少了对交易数据库的扫描次数,提高了挖掘效率.
智能交通系统(Intelligent Traffic System,简称ITS)能够有效提高路网使用效率,解决城市交通拥挤和安全等问题。在智能交通控制系统中,车流量统计和网络通信是两个最基本的要
【中图分类号】G623.5【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2016)20-0141-02  一、教材分析  本节课是北师大版小学数学五年级上册第一单元“倍数与因数”的第5节“找质数”。本节课是在学生已经学习了2,3,5的倍数特征以及掌握了找一个数的因数的方法的基础上进行教学的,通过本节课的学习,为后续学习公因数、约分、公倍数、通分奠定基础。这节课的知识目标是结合具体活动,认识、理
【中图分类号】G633.3 【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2016)17-0192-02  “人的美丑是先天带来的命运,有没有素养则是书籍造就的命运。”莎士比亚深信,阅读的习惯会决定一个人后天的命运。  而课程改革的实施使得我们高中语文教学业已开始如沐春风,高中语文教学的根本是促进学生通过课堂去不断地提高语文素养,养成继续学习以及终身学习的能力。作为语文老师,我们正好通过这个契
【摘 要】反向思维也称之为逆向思维。其本意是当大家都朝着一个方向思考时,却有人独辟蹊径从事物相反的角度去思考问题,而这种思考问题的方法叫做方向思维也称逆向思维。这种与常人所不同的思考问题的思维在小学数学教学中经常被提出,因其思维能丰富学生的创新及其换角度思考的能力,使得学生在面对问题时能从多种角度出发来考虑问题。本文就反向思维在小学数学教学中的重要性及其意义进行了探讨和研究。  【关键词】反向思维
由于地震所造成的灾害和损失及其影响日益加重,并且目前仍无法准确的预测地震,全球防灾减灾工作的重点仍然放在工程结构抗震设计、地震发生后的应急救援等工作中。及时有效的震后救援离不开救援通道的开辟,因此对应急桥梁的轻便性、承载力的研究倍受关注。本文参考ZB-200型装配式公路钢桁梁桥结构形式,结合预应力技术,以轻质重载为优化目标,基于有限元分析软件MIDAS和ANSYS,对简支钢桁梁结构进行了静力性能优