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蛋白质复合体是各种各样生物学过程的基础,广泛深入地研究这些蛋白质复合体对于揭示和建立蛋白质的功能及调节的模型是非常重要的。胰腺癌是一种难以早期诊断、难以治愈、发病率逐年上升的高致死性癌症。本研究,利用凝胶电泳结合质谱的方法研究了不同胰腺癌细胞系中具有重要功能的蛋白质复合体：20S蛋白酶体、热休克蛋白相关蛋白质复合体和14-3-3蛋白二聚体。哺乳动物中,20S蛋白酶体的分子量约为700kDa,由28个分子量在21-34kDa之间,pI为3-10的亚基组成,其结构为空心圆柱体结构。在研究中,通过非变性凝胶电泳(CN-PAGE)及双向凝胶电泳(2-DE)的分离以及质谱鉴定得至SW1990、PANC-1、BxPC-3及CFPAC-1四株胰腺癌细胞系中20S蛋白酶体亚基及其亚型的信息,并且发现免疫亚基β1i和β2i在四株细胞系中的表达存在明显差异。热休克蛋白(HSPs)是一类在进化上高度保守的蛋白质家族。通过第一向的梯度非变性凝胶电泳(CN-PAGE)及第二向的SDS-PAGE的分离结合质谱鉴定,一系列的热休克蛋白相关蛋白质复合体得到分离和鉴定,并且发现在SW1990和PANC-1两株胰腺癌细胞系中这些蛋白质复合体的表达存在差异,大部分差异表达的蛋白质是肿瘤相关蛋白,如HSP60, protein disulfide-isomerase A4(ERp72)和transitional endoplasmic reticulum ATPase (TER ATPase)等。14-3-3蛋白是分子量在28-33kDa之间,存在于所有真核生物中的酸性蛋白质。哺乳动物中有七种不同的14-3-3蛋白家族：β/α,σ,ε,ζ/δ,θ/τ,η和γ。本研究中,通过非变性凝胶电泳(CN-PAGE)分离得到两株胰腺癌细胞系中的14-3-3蛋白二聚体,然后通过2-DE的分离和质谱的鉴定,获得二聚体中七种14-3-3蛋白亚基及其亚型的信息,并且发现14-3-3σ亚基在两株细胞系中的表达存在明显差异。