随着经济全球化步伐的不断加快，当前世界经济发展中区域一体化的态势越来越明显，全球化与区域一体化不断发展的同时，城市化、工业化和现代化也都加快了进程，随之而来的就是各种错综复杂的跨域性公共问题，这些问题都是跨区域、跨领域以及跨部门的。这就要求我们构建一个有效的跨域地方政府合作机制，通过地方政府间的有效合作，积极推动跨域治理中出现的公共性问题的有效解决以促进区域经济的高速发展。地方政府作为我国整个行政管理体制中重要的组成部分，对我国地方政府间的合作机制研究对在跨域治理背景下的中国政府有着积极意义，特别是地方政府间合作已趋于成熟的美国和欧盟，对于研究我国地方政府间的合作机制有着很好的借鉴意义。本文的研究重点是跨域治理中地方政府合作机制的构建，文章主要分为五个部分：第一部分是导论，阐明了问题的提出及研究意义、国内外的研究现状、本文的研究方法以及可能的创新之处。第二部分阐述了跨域治理及地方政府合作机制的概念，提出合作收益理论、囚徒困境理论作为本研究的理论基础。第三部分主要是对我国跨域治理中地方政府合作机制形成的动因进行了详细的分析，我国各地方政府要在跨域治理中进行合作是协调区域经济发展、协同处理公共社会问题以及建设服务型政府的需要。第四部分详细的分析了我国跨域治理中的地方政府合作机制的现状及目前存在的困境。我国的跨域治理目前建立众多的区域经济合作组织、交流与合作的具体形式多样化、合作领域与合作内容不断扩展并且合作的经济成果突出，但同时也存在着一些困境，制度缺失使合作难以持久、行政分割导致了地方保护、组织缺乏造成合作水平低以及产业同构使合作难以持续等。第五部分作为文章的落脚点与第四部分中的困境部分相呼应，从树立“利益共同体”的理念、建立完善的地方政府间合作制度、创建科学的地方政府间合作体制、构建有效的地方政府间合作机制等方面提出我国跨域治理中地方政府合作机制的构建。