在当今的科学系统中,科学基金可谓最重要的公共资源之一。科学基金通过对学术机构、研究人员和课题项目的经费支持,提供了整体面上和关键领域的科学创新支撑。因此,科学基金资助下的成果产出、影响与合作模式等方面,都是学界普遍关心的问题。以客观和定量的范式解读科学系统中的要素,一直是科学计量孜孜以求的目标。但是,长期以来,关于科学基金资助成果的计量研究一直处于发展缓慢的状况,主要原因是缺乏统一、规范和可重复验证的大规模数据源。直到近年,Web of Science等计量学通用数据库逐渐开始记录论文受基金资助的信息,使得大样本、可重复的基金计量与测度研究成为可能。本研究主要利用WoS的大样本数据,以科学计量学、信息计量学和网络分析为核心范式方法,从国家／地区、学术机构和学科领域的宏观或中观视角,对科学基金资助下的基础科学创新成果论文产出、影响与合作结构进行了较系统的探索性研究。主要结论为：在国家／地区层面,自然科学领域的基金资助率已超六成,基金成果已成为基础科学创新产出的主要部分；无论在自然科学领域还是社会科学领域,科学基金都有效地提高了学术成果的影响力；在主要的国家／地区中,中国在自然科学和社会科学中的基金资助率都位列第一；但是,总体上,各国家／地区社会学科的基金资助率都远低于自然学科,亟待加强。机构层面,以物理学为例的实证显示,科学基金资助能显著提升机构的影响力指标(引文指标)；特别是,科学基金资助对于各机构最高影响力成果的产出起到了至关重要的作用。学科层面,以经济学为例的实证显示,经济学基金论文中的总被引次数与基金论文数、基金论文h指数之间呈现了近似的幂律关系；经济学作为主流社会学科,但基金资助率低于社会学科总体；基金资助不仅能提高论文被引,还可提高论文使用量；但是,本研究数据没有证实最高引论文与基金资助之间的关联。在合作结构方面,基金资助下各国合作结构具有差异：以美国等为代表的发达国家在合作广度和强度上都有体现,而以中国为代表的新兴大国虽有较高的合作总强度,但广度有限,对发达国家的合作依赖现象显著；无论是物理学数据还是经济学结果,都显示近年基金资助下的合作格局除了欧美子群的活跃外,还有东亚子群的兴起；本文结果并未证实科学基金能扩大学术机构的合作范围与广度,但显示科学基金资助能增强学术机构与骨干合作伙伴的合作强度。本文重点将计量学的理论与方法引入并应用于宏观与中观的基金资助分析,探索了基金资助对各类科学实体的现实作用,可为今后政府和学界相关部门基金资助的研究与实践的制定提供参考。科学基金的计量研究,也有望成为今后科学计量学与信息计量学的固定领域之一。