杂色山雀（Parus varius）属雀形目,山雀科,山雀属,是一种分布区域狭窄、雌雄同色同型的小型森林洞巢鸟类。指名亚种P.v.varius在中国大陆的分布范围很狭窄,主要分布于辽宁的中、东、南部山区和毗邻辽东山区的吉林省部分山区。因为这种分布地的局限性,导致国内对杂色山雀的研究很少,而基于多基因标记的遗传多样性研究更是未见报道。遗传多样性是非常重要的生物资源。开展杂色山雀遗传多样性的研究和分析是我们进一步对其物种发展和种群延续进行保护的基础。本研究通过使用线粒体DNA控制区序列和核基因微卫星标记对大陆杂色山雀种群的遗传多样性进行了分析,主要得到以下结果:1)线粒体DNA控制区:在68个样本中得到长度529 bp的控制区序列,其中有14个变异位点,包括11个单变异位点和3个简约信息位点;核苷酸多样性π、单倍型多样性h和平均核苷酸差异数K分别为0.0017、0.5328、0.8917。结果显示基于线粒体DNA控制区序列的杂色山雀遗传多样性较低。中性检验和错配分布图说明大陆杂色山雀种群没有经历过种群扩张。基于邻接法和最小进化法构建的系统发生树显示大陆杂色山雀种群分化不明显,没有形成与采样地相对应的地理格局,说明大陆杂色山雀属于一个地理种群。2)核基因微卫星标记:9个微卫星位点的等位基因为6~16个,平均为11.78个;观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.651、0.779和0.755。9个核基因微卫星标记所显示的遗传多样性较高。其中4个位点没有偏离Hard-Weinberg平衡,另外5个位点显著偏离了Hard-Weinberg平衡。不论是等位基因频率的图形检查法,还是等位基因频率分布的缺口分析法,都显示出大陆杂色山雀种群近期很可能没有发生过瓶颈效应。综上所述,从长期的发展历史来看,中国大陆杂色山雀种群一直处于分布范围狭窄,种群数量有限的状态,其遗传多样性较低;但近期其种群数量稳定,没有经历瓶颈效应等打击,遗传多样性保持较好。