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本研究分别利用我国113个水稻地方品种和“龙锦1号/香软米1578”杂交后代F3家系群196个株系，探讨了我国水稻籽粒地方品种铁含量的差异和Fe、Se元素含量的遗传变异及QTL定位，其研究结果如下：
1.113份水稻地方品种的铁含量变异范围为8.1mg·kg-1～19.9mg·kg-1，平均值为11.5mg·kg-1，变异系数为15.56％。
2.各省份水稻地方品种的平均铁含量大小顺序为吉林＞江西＞福建＞广东＞安徽＞四川＞云南＞广西＞江苏＞湖北＞湖南＞贵州。
3.粳米的铁含量显著高于籼米；糯米的铁含量显著高于粘米;紫米的铁含量显著高于普通米和红米。
4.龙锦1号Fe含量为27.8mg/kg，而香软米1578Fe含量为57.5mg/kg，香软米1578的Fe含量明显高于龙锦1号。F3代家系群籽粒Fe含量平均值为35.06mg/kg，变异范围为13.5～64.5mg/kg，表现为较大的变异。水稻籽粒Fe元素含量均呈现接近正态的连续分布，认为Fe含量为由多基因所控制的数量性状。
5.龙锦1号的Se含量为80μg/kg，而香软米1578的Se含量为10μg/kg，龙锦1号的Se含量明显高于香软米1578。F3代家系群籽粒Se含量平均值为47.89μg/kg，变异范围为3.0～270.0μg/kg，表现为较大的变异。水稻籽粒Se含量均呈现接近正态的连续分布，认为Se含量为由多基因所控制的数量性状。
6.利用区间作图法，通过对杂交组合“龙锦1号/香软米1578”F2分离群体200个单株的SSR标记分析，构建了一张包含130个SSR标记，覆盖水稻基因组约2374.1cM，标记间平均距离为18.26cM的遗传连锁图谱。
7.检测到与籽粒Fe含量相关的QTL2个，分布于第1、2染色体上的RM9～RM5、RM525～RM3220区间，对表型变异的解释率分别为11.71％和9.15％。其中，位于第1染色体上的qFe1的增效等位基因来自亲本龙锦1号，而位于第2染色体上的qFe2的增效等位基因来自亲本香软米1578.
8.检测到与籽粒Se含量相关的QTL4个，分布于第5、7(2)、10染色体上，对表型变异的解释率分别为6.23％、12.23.％、9.21％和4.22％。其中位于第5染色体RM164～RM3476区间的qSe5和第10染色体RM5620～RM1125区间的qSe10的增效等位基因均来自亲本龙锦1号，而位于第7染色体上RM418～RM432区间的的qSe7-1和位于RM432～RM11区间的qSe7-2的增效等位基因均来自亲本香软米1578。