南矶山湿地自然保护区位于中国最大的淡水湖，鄱阳湖主湖区南部，是水鸟重要的越冬地和中转站，是东亚—澳大利亚迁徙水鸟迁飞区内的一个重要环节。从上个世纪八十年代，陆续有一些专家学者及有关部门开始对鄱阳湖湿地的鸟类资源进行考查，但主要涉及冬季迁徙水鸟及其濒危物种。为进一步了解南矶山湿地自然保护区的鸟类群落结构，季节性变化以及其与不同栖息生境之间的关系，作者于2005年9月—2007年3月对南矶山自然保护区的鸟类资源进行调查，并对鸟类群落的多样性进行研究。主要结果如下：1．本次调查共记录鸟类178种，隶属13目40科。这些鸟类中候鸟共101种，占保护区鸟类总种数的56.7％，其中冬候鸟77种，占鸟类总种数的43.3％，夏侯鸟24种，占鸟类总种数的13.4％；留鸟和旅鸟分别为39种、38种。从区系组成看，古北种为优势类群，共有96种，占该地区鸟类种数的53.9％；广布种和东洋种分别为50种、32种。2．在南矶山湿地自然保护区的178种鸟类中，有东方白鹳等国家Ⅰ级重点保护鸟类4种，灰鹤等国家Ⅱ级重点保护鸟类18种，被列入IUCN受胁鸟类9种(极危种1种、濒危种2种、易危种6种)，被列入《中国濒危动物红皮书》鸟类13种(稀有种2种、濒危种4种、易危种6种、不确定种1种)，被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》的鸟类26种(附录Ⅰ5种、附录Ⅱ13种、附录Ⅲ8种)，被列入《江西省重点保护野生动物名录》的鸟类47种，被列入《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的动物名录》的鸟类有133种。3．采用Shann-Wiener指数、Pielou均匀性指数对南矶山湿地自然保护区鸟类群落的多样性进行了研究，结果表明，四个季节中，春季的鸟类群落多样性指数最高(3.11)，其后依次为秋季(2.91)、冬季(2.90)、夏季(2.65)。南矶山湿地自然保护区全年的鸟类群落多样性指数为3.19。4．对水鸟群落进行了周年观察，按鸭科、鹭科、鹆鹬类等类群分析其季节性动态，并讨论了湿地水鸟群落与生境的关系，以便对该保护区的建设提供参考。由候鸟构成的水鸟主体，使全年水鸟种数有明显的高峰和低谷波动，总体呈现秋冬多，夏季少的趋势，许多候鸟春季集中在2—3月份迁徙，这一时期出现了物种的高峰期。从南矶山湿地雁鸭类现存生物量上分析，食湿生植物集团>食水生植物集团>食鱼虾底栖动物集团，最适觅食水深从大到小依次为：陆地觅食>浅水觅食>深水觅食。与历史群落的组成对比可知水生植被(特别是沉水植被)的衰减与冬季湖水水位过低，是致使多数雁鸭种群下降的两个主要原因。5．结合保护区的实际自然状况，我们总共划分出6个生境的鸟类群落：农田群落(包括村落、房舍和农田)、草洲群落、灌丛群落、湖泊群落、滩涂群落、水塘+河道群落，并对这6个鸟类群落的组成、群落的多样性和均匀性、群落间的相似性进行了分析和讨论。6．基于以上研究与调查，分析了现阶段南矶山湿地自然保护区面临的主要威胁：传统捕鱼方式对湖区候鸟栖息地的严重破坏；草州放牧、非法捕猎和毒杀水鸟，农业开发等人为干扰；保护区机构不完善，管理体制不顺畅。并根据这些问题提出了相应的保护建议。