近几年,高校科研经费贪污案件频发,这给国家带来巨大的损失,令人深感痛心。2014年,中央第十二巡视组进驻复旦大学。公开资料显示,科研经费管理和使用混乱是此次巡视复旦大学过程中发现的突出问题之一。复旦大学作为我国顶尖大学,承担着为国家培养一流人才和推出先进科研成果的重任,却也同样在科研经费的管理上出现纰漏。事实上,在我国高校中,科研经费的管理问题是广泛存在的。由于地域分布和资源获取方面的差异,各大高校在科研经费管理方面所存在的问题也就不尽相同。因此,实地调研S大学计划财务处、科研处、审计处等部门,观察相关工作流程并走访相关工作人员,针对S大学存在的科研经费管理问题,分析S大学科研经费管理问题背后的原因,进而提出对策建议,具有一定的现实意义。本文在理论分析的基础上,对S大学进行案例分析。把握科研经费管理相关理论和概念,梳理我国针对科研管理工作所出台的办法和规定,进而探究当前S大学科研经费管理存在的问题及深层原因,为下一步解决问题提供依据。之后,结合国内外高校在科研经费管理方面的经验和不足,为S大学科研经费管理提供相应对策做准备。本文通过调研发现,当前S大学存在科研人员的预算编制不合理、报销不合规章以及结题资金监督缺失等问题。这些问题的背后,是S大学科研项目预算管理的不规范、经费与项目管理脱节、监督缺失以及没有绩效评价和激励等。与此同时,国外部分高校在绩效评价、管理人性化等方面走在了我们的前面,这些先进经验是值得我们借鉴的。本文认为,优化S大学经费管理流程、提高S大学经费利用效率,应着眼于以下几点:规范和优化预算编制,妥善处理“报销难”的问题;建立服务型管理机构,在全校营造轻松愉快的科研氛围;探索和建立绩效评价和激励制度,焕发科研的活力;完善审计监督,严肃处理违规违纪行为,净化科研人员工作环境等。