基于RAD-seq技术和形态学特征对中国茶藨子属的系统发育研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:Dream_624727
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茶藨子属(Ribes L.)属于茶藨子科(Grossulariaceae)植物,具有重要的食用价值、药用价值以及园林绿化观赏价值。由于茶藨子属植物形态变异幅度大,且具有单性花和两性花两种类型,导致分类难度大。各个亚属的系统位置及其亲缘关系尚未明确,属内系统发育关系一直未得到解决。本研究基于RAD-seq测序技术,提取了野外采集的中国茶藨子属31种52份材料的基因组DNA,进行RAD-seq高通量测序,SNP位点检测和注释后进行了系统发育分析。同时,采用形态学数量分类方法,观测了 33种茶藨子属植物的20种形态特征,利用SPSS 22.0软件进行聚类分析和主成分分析。本研究主要得出以下结论:1.基于RAD-seq技术的系统发育分析将52份材料划分为6个分支,即6个亚属,与中国植物志中茶藨子属分类系统并不完全一致,支持把臭茶藨子亚属(subg.Coreosma)从茶藨子亚属(subg.Ribesia)独立出来;支持把伞形花亚属(subg.Parilla)从单性花亚属(subg.Berisia)中独立出来;验证了醋栗亚属(subg.Grossularia)作为独立亚属的合理性;原属于茶藨子亚属的曲萼茶藨子(Ribes griffithii Hook.f.et Thoms.)作为独立一个亚属,还需要扩大采样范围做进一步研究。2.形态特征数据分析将33种茶藨子属植物聚类为8个分支,印证了分子进化树关于醋栗亚属、单性花亚属、伞形花亚属、臭茶藨子亚属和茶藨子亚属的聚类结果;将常绿茶藨子类群提升为常绿茶藨子亚属(subg.Davidia);支持将香茶藨子(Ribes odoratum Wendland)划分为管萼茶藨子亚属(subg.Symphocalyx);支持将密刺茶藨子(Ribes horridum Ruprecht ex Maximowicz)划分为密刺亚属(subg.Grossularioides)。结合R型聚类分析以及主成分分析结果,选择了 20个有代表性的形态学性状。3.在RAD-seq系统发育分析的基础上,结合形态学性状聚类分析。我们支持将中国茶藨子属划分为7个亚属。即茶藨子亚属、单性花亚属、臭茶藨子亚属、伞形花亚属、醋栗亚属、密刺亚属和常绿茶藨子亚属。4.根据分子系统学证据,结合形态地理学证据,拟将新疆阿勒泰地区采集的新类群(1819ZB)定为高茶藨子(Ribes altissimum Turczaninowex Pojarkova)的种下分类单位;拟将光果茶藨子(Ribes laurifolium Jancz var.yunnanense L.T.Lu)由桂叶茶藨子(Ribes laurifolium Jancz.)的变种提升为种级水平。
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