多年来城市轨道交通对我国城市现代进程中做出了无法比拟的贡献。城市轨道交通建设的健康稳定发展对于国民经济有着无法替代的重要意义。而作为城市轨道交通的建设者,城市轨道交通建设单位亦在其建设中发挥领导和推动作用。同时由于建设单位的非盈利性、公益性、社会性以及其在建设过程掌控庞大的建设资金,为了防止国有资产流失、降低建设管理风险、保证城市轨道交通建设项目的安全和稳定,构建安全、有效、稳定的内控体系势在必行。本文通过对国外、国内内控理论发展历程进行了分析,并参考了国外和国内内控研究的新理论观点,结合了建设单位的实际情况,对建设单位内控存在问题进行了系统的分析,归纳总结了其内控的特点。依据财政部、证监会等五部委联合发布的《企业内控基本规范》及相关配套指引文件并结合城市轨道交通建设单位的实际情况,确立了城市轨道交通建设单位内控体系的构建目标和原则,分析了对城市轨道交通建设单位内控构建产生影响的几个问题,主要包括成本与收益的问题,内控稳定与发展的关系,内控的局限性以及信息化对内控的作用。确立了城市轨道交通建设单位内控框架的构建目标,落实了内控的责任方和控制线路,并制定了运行策略和基本原则以及监控保障机制。然后运用层次分析法和模糊综合评价法对以B公司为例的建设单位内控体系进行了评价。最后是对本文研究内容的总结,并指出了本文的局限性,并对城市轨道交通建设单位内控发展提出了建议,并对未来的研究重点进行了展望。