西藏半野生小麦是中国特有的宝贵种质资源，遗传多样性的评价是其保护、开发和利用的基础。断穗也是育种中需要克服的性状。本项目是在我们和前人研究工作的基础上，采用新开发出来的EST-SSR标记，系统分析了西藏半野生小麦的遗传多样性，并对断穗基因进行SSR分子标记定位，取得以下主要结果： 1)采用了EST-SSR标记，对93份不同类型的小麦近缘种属材料(西藏半野生小麦60份、普通小麦12份、斯卑尔脱小麦7份、野生二粒小麦8份，粗山羊草5份)进行了群体内及群体间的遗传差异分析。结果表明，六倍体小麦(西藏半野生小麦、普通小麦和斯卑尔脱小麦)群体内部遗传差异均较小。而从不同类型材料间的遗传差异来看，西藏半野生小麦与普通小麦的遗传距离、斯卑尔脱小麦与普通小麦的遗传距离均大于普通小麦群体内的遗传距离，可以利用西藏半野生小麦与斯卑尔脱小麦来拓宽普通小麦育种的遗传基础。 2)根据遗传距离进行聚类分析的结果显示，普通小麦、西藏半野生小麦和斯卑尔脱小麦聚为一个类群，进而又分别单独聚为不同的亚组。这一结果从分子水平上支持了西藏半野生小麦和斯卑尔脱小麦作为普通小麦种内的一个亚种的分类，与前人的研究结果相吻合。 3)利用SSR分子标记，将西藏半野生小麦断穗基因定位到3D染色体上，筛选到2个与西藏半野生小麦断穗基因连锁的标记xgdm72和xgdm8，遗传距离分别是29.1cM和45.8cM。 4)斯卑尔脱小麦是又一具有断穗特性的六倍体小麦，利用已经建立的SSR遗传连锁图谱，将斯卑尔脱小麦的断穗基因定位在了5A染色体的长臂上，推测斯卑尔脱小麦的断穗是Q基因的效应之一。