土壤微生物在生态系统中起着举足轻重的作用，其多样性是全球生物多样性的重要组成部分，可作为评价土壤质量的一项重要指标。本论文通过田间种植和人工残体掩埋,利用微生物稀释平板法、BIOLOG实验、变性凝胶梯度电泳（DGGE）分析及土壤酶活性检测，比较GFP叶绿体转基因烟草及其亲本，在小苗期，壮苗期，开花期和成熟期土壤微生物群落的变化,探讨 GFP叶绿体转基因烟草对土壤微生物群落结构和功能多样性的影响。为综合评价叶绿体转基因植物的生物安全性提供科学依据。主要实验结果如下：　　1.在烟草整个生长时期，根际土壤可培养微生物数量在小苗期较少，至壮苗期数量开始迅速增加，到花期达到最大值，成熟期则开始有所减少。在不同生长期内，GFP叶绿体转基因烟草与非转基因烟草对照相比，根际土壤可培养微生物数量差异不显著。　　2.在烟草整个生长时期，GFP叶绿体转基因烟草与非转基因对照烟草的根际土壤脲酶、蛋白酶、过氧化氢酶、多酚氧化酶、蔗糖酶、纤维素酶活性变化趋势相似，都是在小苗期较少，至壮苗期酶活性开始迅速增加，到花期达到最大值，成熟期开始减少。但二者酶活性均未见显著差异。　　3. BIOLOG实验结果表明，GFP叶绿体转基因烟草与非转基因对照烟草根际土壤微生物在BIOLOG微平板上的平均每孔颜色变化率(AWCD)趋势一致，差异不显著；多样性指数及主成分分析显示，除了在小苗期有短暂的显著差异外，在花期和成熟期，二者差异均不显著。　　4. DGGE分析结果表明，在烟草整个生长时期，叶绿体转基因烟草对根际土壤细菌群落多样性的影响略有不同，但方差分析表明叶绿体转基因烟草对烟草根际土壤细菌多样性没有显著性影响。　　5.在烟草茎叶降解过程中及完全降解后，叶绿体转基因烟草及对照烟草(非转基因烟草)对微生物的数量影响不显著；总量相比：细菌>放线菌>真菌；叶绿体转基因烟草茎叶降解对土壤酶活性没有显著影响；GFP基因没有水平转移到土壤微生物基因组中。GFP叶绿体转化烟草茎叶降解对土壤微生物数量及土壤酶活性没有显著的影响。　　综上所述，GFP叶绿体转化烟草对土壤微生物数量及土壤酶活性没有显著的影响。