基因组进化与种间亲缘关系量度

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:byekao
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随着生物多样性丧失的加剧,生物多样性的保护越来越为人们所重视,这就需要人们能够更好的了解多样性水平。然而传统的多样性指数大多建立在物种多样性的基础上,这类指数缺少对物种种间进化关系的描述,因此以它们为标准来制定的保护措施不能为生物多样性提供最好的保护。虽然近年来也有很多研究开始将谱系信息考虑进来,但基本上停留在对物种的谱系树的简单描述水平,缺少深层次的机理的探讨。   本文从分析基因组进化过程出发,利用谱系树所表达的进化信息,研究一个物种中所包含性状的进化历史,从而构建出性状分解框架:在该框架下,可以看到在一个物种的一次进化过程中产生的性状数量,又分别以一定的概率被这个进化枝的所有现存物种保留。这2个数据对于构建多样性保护标准的指数有非常重要的意义,因为它不仅从遗传多样性水平上描述了生物多样性,同时又提供了物种间性状亲缘关系的描述。本文中我们分别从物种的性状特异性,物种的性状稀有性及物种组的性状多样性几个方面探讨了如何使用该框架来构建相关的指数,并使用美洲70种陆地肉食动物构建的谱系树作为实例,以比较本研究的指数与现有指数的差异。结果表明本文的指数与现有指数表现出一定的相似性,并能更好地区分物种的特异性。
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