独立董事制度是上市公司内部治理结构重要组成部分，独立审计是健全上市公司外部治理机制的有效手段，两者之间具有共性。完善的独立董事制度是保障注册会计师独立、客观、公正执业、切实发挥审计鉴证作用、提高独立审计质量的重要条件。同时，注册会计师行业应注重维护自身的独立性，提供高质量的审计信息，并就与财务报表审计相关、且根据职业判断认为与治理层责任相关的重大事项，以适当的方式及时与独立董事沟通，便于独立董事完整、深入了解上市公司，以有效行使决策权。注册会计师的监督作用与独立董事的制衡作用的合成对于上市公司的稳健运行将起到良性互动作用。独立董事提升了独立审计的“独立性”，独立审计奠定了独立董事“独立视事”的制度基础。本文主要通过对我国上市公司独立董事行权的典型案例分析，以及采用统计方法，以2004、2005年在沪深两地上市的84家浙江省上市公司为例，对独立董事制度和独立审计的相关性进行分析。研究结果表明：(1)独立董事制度和独立审计，对于提高我国上市公司的治理效率具有一定作用。(2)独立董事制度和独立审计具有相关性。独立董事在董事会中所占比例较高者，公司业绩相对较高，表现在每股收益(扣除后)、净资产收益率、总资产收益率三个指标。同时公司相对更能获得标准无保留的审计报告。