随着人类基因组计划的完成,生物数据以海量的速度在增长,生物科学家面临着新的机遇和挑战。生物信息学跨越了生物科学和计算机科学,使用计算和分析方法来处理生物数据,成为一门新兴的前沿学科。生物数据数量的迅速增长造成数据间语义的不一致的现象也越来越多。语义网和本体论为解决生物数据语义不一致的问题提供了有效的解决途径。OBO(Open Biomedical Ontologies)是一系列关于生物和医学本体的综合,这些本体通过统一定义的文件格式来描述生物数据,使得生物数据的语义能够得到确定。针对OBO本体研究的需要,实现了基于Struts框架的软件平台OBO-Parser,它包括解析用户提交的OBO文件、计算术语间语义相似度和转换OBO文件格式到OWL格式等功能模块。该软件平台基于J2EE的B/S三层结构,具有良好的延续性、可复用性和高安全性等特点。该软件平台通过浏览器即可访问,用户提交的OBO文件将按照OBO文件规范自动的解析并存储到后台数据库中。为了计算术语间的语义相似度,该软件平台实现了基于语义路径覆盖的模型,保证了计算的准确度。该软件平台实现了按照设计的转换规则将OBO文件格式转换成OWL格式的功能模块。