DSG基因中遗传多态与SCD易感性关联研究及功能分析

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Moke_jlsf
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:探索DSG2基因3’UTR中的rs397729601多态位点与中国汉族人群中心源性猝死(Sudden cardiac death,SCD)风险性的关系,并且进一步探讨这个多态位点在SCD中如何发挥作用及其潜在的分子生物机制。研究方法:(1)筛选多态位点:利用生物学信息技术,筛选位于DSG2基因3’UTR的多态位点,并且选取其中的一个2碱基对的插入/缺失多态位点(rs397729601)作为候选对象。(2)SCD病例组与正常对照组研究:提取124例SCD和656例正常对照血样的DNA进行PCR扩增并电泳,银染显色后记录各血样在rs397729601的基因型,并运用Logistic回归统计分析rs397729601与心源性猝死风险之间的关联。(3)基因型-表型关联分析:采用qPCR技术检测心肌组织中DSG2 mRNA的表达量,并进行分析。(4)预测MicroRNA(miRNA):使用Miranda预测能与DSG2 3’UTR结合且受rs397729601影响的miRNA。(5)构建载体和双荧光素酶报告基因检测:构建包含rs397729601多态的重组质粒载体pGL3-control-DSG2-MT/WT并转染293T细胞系,分为实验组和对照组,使用双荧光素酶报告基因分析系统分别检测荧光素酶活性,验证miR-933-3p对DSG2基因表达的影响。实验结果:(1)基因分型结果显示,rs397729601多态位点具有良好的多态性,此次实验选用的正常对照组样本基因型频率分布符合HWE,具有群体代表性。校正性别与年龄的影响后,Logistic回归法分析显示:携带缺失型等位基因的个体比携带插入型等位基因的个体有更高的SCD风险(OR=1.53,95%CI:1.14-2.04,P=2.97×10-3)。(2)q-PCR结果显示,Del/Del和Ins/Del基因型心肌组织中DSG2 mRNA的相对表达量是Ins/Ins基因型心肌组织的2.69倍(P<0.001)。(3)生物信息学预测结果提示,hsa-miR-933-3p能与DSG2 3’UTR结合且受rs397729601多态影响。(4)双荧光素酶分析结果显示,在对照组中,与MT组相比,WT组荧光素酶活性显著降低(P<0.05)。加入外源性miR-933-3p后,MT实验组与对照组相比无明显变化。然而,WT实验组与对照组之间存在显著差异(P<0.001)。实验结论:(1)rs397729601多态在中国汉族人群中与SCD风险之间显著相关。(2)rs397729601多态可能通过干预DSG2 mRNA与hsa-miR-933-3p结合来影响基因的表达,从而参与SCD的进程。(3)rs397729601多态位点可能成为SCD分子诊断和遗传咨询的潜在标志物。
其他文献
实验背景:二维纳米材料具有独特的物理化学性能,得到广泛研究,特别是石墨烯的产生。近年来,研究发现,许多二维纳米材料具有良好的生物安全性,这使得二维纳米材料在生物医药应用具有巨大的潜能。目前用于研究癌症治疗的二维纳米材料有过渡金属二硫化物、黑磷、二维过渡金属碳化物或碳氮化物、层状双氢氧化物等。硒化锑(Sb2Se3)纳米片是新剥离出的二维材料,由于二维材料的相似性,将探究其生物应用价值。实验目的与方法
我国是一个瓜果蔬菜的消费大国,拥有广袤的国土面积,但是可耕种土地较少,且大部分的耕种土地用来生长粮食,瓜果蔬菜的种植面积不足,传统的种植方式无法满足人们对于瓜果蔬菜
巷道作为地下交通的一种,具有运矿、通风、排水、行人等功能,由于其不占用地表面积,且造价成本合理等原因,深受地下工程重视。但是巷道往往会因为开挖、撞击等原因,产生瞬时性的弹性破坏;同时还可能因为围岩为软岩,产生使得应力和位移随时间推移逐渐变大,直至围岩破坏的粘弹性破坏。两种破坏都会影响工程的安全施工,所以十分有必要对其进行分析研究。本文首先采用复变函数理论对无衬砌巷道围岩的弹性解进行了研究,并应用A
板类构件在工业领域应用非常广泛,尤其是不规则板件,如曲面板件,变厚板件,在航天航天、汽车装备和船舶化工等各行各业发挥着重要的的作用。但是,由于板类构件在加工过程中需要加热、穿孔、高速挤压等多重工艺的影响,难以避免出现裂纹、气孔等缺陷,这些缺陷的存在给工业生产带来了巨大的安全隐患,故针对板类构件的无损检测方法研究具有极其重要的意义。本文针对板类构件,采用阵列导波换能器进行检测方法研究,论述了阵列导波
灾害性天气的集合预报是目前数值天气预报的研究热点,对保障人民生命财产安全有重要的意义。本文对一次冷涡暴雨过程基于传统增长模繁殖法(BGM)和集合变换卡尔曼滤波法(ETKF)开展集合预报试验,研究了不同初始扰动方法在区域集合预报中的表现。随后基于天气系统在发生发展过程中的局地差异性,引入局地增长模繁殖法(Local Breeding Growth Mode,Local-BGM)生成初始扰动,进行集合
近年来,随着以卷积神经网络(Convolutional Neural Network,CNN)和循环神经网络(Recurrent Neural Network,RNN)为代表的深度学习的兴起,场景文本检测的研究取得了新的发展。
移动互联网和物联网发展迅速,大量设备接入网络,万物互联的时代正在到来。现有的通信技术已不能满足人们的需求。因此,有必要研究具有更高频谱效率的通信技术。非正交多址(NO
人脸数据蕴含丰富的特征信息,是人体特征中唯一易见易获取且包含丰富的差异化特征的数据,因此在较多领域都有着重要的应用价值,包括安全领域的人脸识别、人群检测与目标跟踪,
A群牛轮状病毒(Group A Bovine Rotavirus,BRVA)是重要的犊牛腹泻病原之一。VP6基因是常用的BRVA分子检测靶点,其编码的VP6蛋白也是常用的血清学检测靶蛋白和亚单位疫苗候选抗
水汽是地球大气层中唯一存在相变的物质,在许多大气物理与化学过程中都起到很重要的作用。大气水汽影响气溶胶和云层的形成,而且其浓度及分布随地域、季节、昼夜、海拔高度的