我国非政府组织在发展过程中存在着一系列突出的问题,主要表现为自身定位不合理、官办色彩浓重、相关法律法规不健全、发展趋势非均衡化、独立发展能力缺乏、国际化水平不高等。究其原因在于：非政府组织自身建设不足,外部监督不力,非政府组织的社会认可度不高,政府管制理念滞后于形势的发展等。本文通过对我国非政府组织的详尽分析,借鉴非政府组织功能发挥的国际比较,对我国非政府组织发展的一系列“短板”问题进行详细的比对分析。在政策环境方面,指出政府对非政府组织坚持双重管理的方式和使其非竞争性的指导原则,导致非政府组织准入门槛儿过高；在财政方面,指出我国非政府组织资金来源渠道单一资金短缺等,导致我国非政府组织缺乏竞争力；在法律保障方面,指出我国非政府组织缺乏完整的法律体制保障,对我国非政府组织的管理主要依赖相关行政法规和部门规章,法律保障效力较低；从我国非政府组织的实践看,指出我国非政府组织在与政府协作时过度依赖于政府,而忽视自身能力的拓展,导致我国非政府组织运作效率低下,投资回报率较低,一定程度上既浪费了资源又降低了政府公信力。通过对我国非政府组织发展“瓶颈”的详尽分析,进一步指出优化我国非政府组织功能的有效路径,指出要创新社会管理方式,构建非政府组织与政府有效协作的协同管理模式,使非政府组织和政府在协同管理境况下共同致力于社会公共事务。具体来说,在职能转变的过程中,政府需要重新市视自己的职能,重新定位非政府组织,减少非政府组织对政府财政的依赖性；非政府组织要加强自身建设,提高自身的资金筹措能力、组织管理能力、活动能力；政府部门应该进一步健全法律法规,降低非政府组织准入门槛,弥补非政府组织法律缺失等问题；打破政府对非政府组织的垄断,提高非政府组织的白治性和竞争力。