本文利用微卫星标记技术，采用9对微卫星引物对凡纳滨对虾三个亲本群体(OI Q、SIS Q、Kona Bay Q)及其子一代(OI Z、SIS Z、Kona Bay Z)进行了遗传变异分析。根据等位基因频率、有效等位基因数、杂合度、多态信息含量、遗传距离、聚类结果和遗传分化系数，评估了各群体内的遗传变异和群体间的遗传关系。结果表明如下： 1、9对微卫星引物中，位点TUMXLV9.145在各群体中均表现为单态，不适于群体的遗传变异分析，其余8个多态基因座中，位点TUMXLV7.56的平均等位基因数最多，达6个；而位点TUMXLV6.124的平均等位基因数最少，仅有2个。各位点平均等位基因数为3.5000个：平均有效等位基因数最多的位点是TUMXLV7.56，达4.3458；最少的位点是TUMXLV8.32，仅1.9209个。 2、8个微卫星基因座在6个群体的有效等位基因数在2.1032～2.3171；基因杂合度变化范围在0.4620～0.5281；多态信息含量为0.4016～0.4590。在亲代和子代群体遗传结构分析中，子代有效等位基因数、杂合度、多态信息含量等指标均略低于亲代，但子代的遗传多样性并没有受到太大影响，仍保持着较宽的遗传基础。 3、Hardy-Weinberg平衡遗传偏离指数(D)结果表明，各群体杂合子过剩和缺失的现象同时存在，但杂合子过剩现象较严重，尤其是位点TUMXLV7.56，在实验的6个群体中全处于杂合子过剩状态。 4、F-统计量分析表明：各微卫星基因座FST值的变化范围从基因座TUMXLV7.56的0.0445到基因座TUMXV5.45的0.3335，其平均值为0.1344；各基因座的N-的变化范围从基因座TUMXLV5.45的0.4997到TUMXLV7.56的5.3732，平均值为1.6109。 5、用Popgene32软件分别计算6个群体之间的Nei氏标准遗传距离Ds，并用MEGA4软件对其进行聚类，结果表明，三个亲本群体与其子代首先各自聚为一类，同时聚类显示OI与Kona Bay群体的遗传距离较近，聚在一起，最后才与SIS群体聚合。所得聚类图与群体的真实关系较为符合。 本研究结果可为凡纳滨对虾的遗传多样性保护、利用、良种选育提供一定的理论依据。