P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测

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P311蛋白广泛表达于多种组织,它参与体内细胞分化、调节其它蛋白/基因转录、创伤修复、肿瘤发生等多种正常或异常的生物学活动。金属硫蛋白是一类广泛存在于生物界的低分子量富含半胱氨酸的金属结合蛋白,因其独特的生物学功能,近年来国内外对金属硫蛋白各方面的研究日益受到重视。经实验研究发现,金属硫蛋白亚型ⅡA(MT2A)参与P311基因表达,并起着关键性的调节作用,说明它们之间存在着相互作用的关系。   由于P311蛋白的结构信息缺失,因此,本文首先采用同源建模的方法构建P311蛋白的三维结构,并使用ProTable分析和Ramachandran图验证了其合理性。   其次,将配体金属硫蛋白ⅡA与P311蛋白的模建结构用Autodock4.0软件进行分子对接,分析二者之间的相互作用。在生成的10个对接结果中,筛选出最合理的结构模型。   最后通过对最终复合物的结构分析,预测出了两者的作用区域,并发现受体蛋白中残基GLU14、SER48以及GLU56分别与配体残基LYS31、ALA61和LYS43相互作用,且都形成了稳定的氢键结构。因此,受体P311蛋白的残基GLU14、SER48以及GLU56成为重要功能残基的可能性很高,为进一步实验研究提供了重要信息。  
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