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放线菌(Actinomycetes)是一类具有重要价值和多种用途的微生物,广泛存在于不同的自然生态环境中。极端环境中存在的放线菌具有不同于一般放线菌的特殊遗传特性、特殊结构和生理功能,以及特殊的代谢产物。盐碱环境作为极端环境的一种,蕴含着大量的嗜(耐)盐、碱放线菌,是极端放线菌生长的理想场所。本研究从塔里木盆地共采集36份盐碱土样,选取2个代表性盐土样,进行2种复合盐、3种预处理方式和6种培养基的筛选试验;同时选取1个代表性碱土样进行干热处理和5种培养基的筛选试验。结果显示,盐环境土样采用120℃1h干热处理,使用印迹法在甘油-精氨酸琼脂培养基、GW1琼脂培养基和高氏一号培养基上分离嗜盐放线菌为宜;碱环境土样自然风干后,使用倍性稀释法涂布在MM琼脂培养基和改良琼脂培养基上分离嗜碱放线菌为宜。从塔里木盆地土样中分离出568株嗜盐放线菌和175株嗜碱放线菌。对具有代表性的77株放线菌株进行16SrDNA序列分析,结果显示,嗜盐放线菌分属在6个属,分别是链霉菌属(Streptomyces),糖霉菌属(Glycomyces),拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),放线多孢菌属(Actinopolyspora),链单孢菌属(Streptomonospora)和糖糖孢菌属(Saccharomonospora);嗜碱放线菌分属4个属,分别是链霉菌属(Streptomyces)、拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),糖单孢菌属(Saccharomonospora),链单孢菌属(Streptomonospora)。对已获得16S rDNA序列的菌株进行PKS基因的筛选,检测结果表明,I型PKS基因的阳性率为34.1%,Ⅱ型PKS的阳性率为32.4%,其中链霉菌属和拟诺卡氏菌属是产生聚酮类化合物最丰富的菌源。这些结果显示本实验分离的放线菌菌株不仅具有种属的多样性,在次级代谢合成相关基因上具有更复杂的多样性。