中国河北汉族人群PADI4单核苷酸多态性与类风湿关节炎的相关性研究Ⅱ

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:seaw2008
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目的:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)是一种以关节滑膜炎症为特征的慢性全身自身免疫性疾病,环境因素和遗传因素在疾病的发生和发展过程中共同起作用。易感基因的研究有助于阐明RA的发病机制,并将可能成为RA的诊断、治疗和判断预后的一个有效指标。本研究的目的在于探讨肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(peptidtylarginine deiminase 4,PADI4 )单核苷酸多态性( Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)与中国河北汉族人群RA易感型的关系。并分析PADI4单核苷酸多态性对抗环瓜氨酸肽抗体(anticclic citrullinated peptide antibody,anti-CCP)水平的影响,为RA的早期诊断、治疗和预防提供科学依据。方法:采用基于医院的病例-对照研究方法,收集河北地区汉族人群无血缘关系的105名RA患者和年龄性别相当的96名健康体检者的外周血。用PCR-RFLP,对PADI4基因第三外显子区域padi492位点SNP进行检测,结合现有的padi494,padi4104两个SNP位点的测序结果,进行连锁不平衡分析及构建单倍体型,进行相关性分析。结果:1在健康对照组及RA病例组中,padi492的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。padi492位点的CC、CG、GG基因型分布在RA病例组与健康对照组相比有显著性差异,OR分别为0.4148(95%CI=0.22540.7635)、1.5758(95%CI=0.90252.7512)、1.7500(95%CI=0.80943.7835)。与其他地区人群比较,河北汉族人群padi492基因型和等位基因频率分布与日本、韩国、英国人群人群所报道的相似(p>0.05),比较没有显著性差异。2应用SHEsis、Genehunter软件对padi492、padi494、padi4104三个位点构建单倍体型,得到了3个主要的单倍体型,分别为CCC、GTT、GCC型。三种基因型分布在RA病例组与健康对照组相比具有显著性差异,OR分别为0.634(95%CI=0.4250.946)、1.306(95%CI=0.8641.975)、4.286(95%CI=1.27414.424)。3把病例组中各个样本按照PADI4基因的功能单倍体型分成三组,在验证方差齐性后用Bonferroni t-text检验各组在发病年龄的差异,经过统计,没有发现各组间存在明显统计学差异(p>0.05)。4把病例组中的各个样本按照PADI4基因的功能单倍体型分成三组,应用卡方检验检验各组性别频数差异,经过统计,没有发现各组之间性别比例存在明显统计学差异(p>0.05)。5把病例组中各个样本按照PADI4基因的功能单倍体型分成三组,在验证方差齐性后用Bonferroni t-text检验各组抗CCP抗体水平的差异,经过统计,没有发现各组间存在明显统计学差异(p>0.05)。6把病例组中的各个样本按照PADI4基因的功能单倍体型分成三组,应用卡方检验检验各组RA疾病分级的频数差异,经过统计,没有发现各组之间存在明显统计学差异(p>0.05)。结论:1 PADI4基因区域的PADI492单核苷酸多态位点各基因型及等位基因频率在健康对照组及RA病例组中的分布存在明显统计学差异。表明此位点多态与RA的易感性相关联。2连锁PADI492、PADI494、PADI4104位点,通过连锁不平衡分析可见三个位点呈现连锁不平衡,构建单倍体型,得到CCC、GTT、GCC三型。分析得出CCC基因型与RA呈负相关,GCC型与RA成正相关,PADI4不同的基因型有可能是RA患病的保护因素或危险因素。但是PADI4的三种主要功能单倍体与RA的发病年龄、性别、血清抗CCP抗体水平在统计学上没有明显差异。3 PADI4各种功能单倍体型虽然与RA发病相关联,但是没有发现其与RA的病程以及临床症状的严重程度有明显关系。
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