SSH技术筛选爪哇根结线虫寄生相关基因的研究

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根结线虫(Meloidogynespp.)是一类重要的植物内寄生线虫,其食道腺含有一个背食道腺和两个亚腹食道腺,食道腺可产生颗粒状分泌物,以液体状由口针排出,刺激寄主细胞的分裂,分化和增生,并引起植物细胞壁的溶解,从而达到其寄生的目的。因此,对根结线虫的食道腺寄生基因的研究可进一步了解其寄生机制,为其防治提供重要的依据。本文以爪哇根结线虫(M.javanica)为材料,首次分离了其食道腺寄生相关基因,并获得了其假定寄生基因的分布图,另外,在分离寄生基因的方法上进行了一些改革,取得了如下结果: 1.利用显微操作技术,用直接微量吸取爪哇根结线虫寄生阶段的二、三和四龄幼虫的食道腺细胞质和肠细胞质;用微量提取mRNA试剂盒(RneasyMicroKit)分别提取咽腺和肠细胞的mRNA,再采用RT-PCR技术合成咽腺和肠细胞的cDNA;利用抑制差减杂交技术(SSH),以咽腺细胞的cDNA为检测子(tester),肠细胞的cDNA为驱赶子(driver),构建富集特异咽腺细胞的cDNA差减文库;对该cDNA文库按片段进行克隆,随机挑取了2112个克隆子转化到JMl09大肠杆菌中培养,并进行PCR检测其转化率;最后,利用基因芯片技术,将随机挑取的2112个克隆的PCR产物以间隔矩阵的方法点在尼龙膜上,以a.32p标记咽腺细胞的cDNA和肠细胞的cDNA为探针,分别与含富集特异咽腺细胞的cDNA尼龙膜杂交,并用磷屏压片,扫描获得2x2杂交信号图。 2.本研究共筛选出105个强信号的阳性克隆,进行测序,其中,94个测序成功,通过在国际互联网NCBI上比对和DNAStar软件中的ClustalW程序分析,去除重叠序列,共获得69个假定寄生性相关基因的EST序列,同时获得一个假定寄生基因分布图。其中,克隆C2-A5与美丽小杆线虫(Caenorhabditiselegans)的假定蛋白ZC328.3有一定同源性,该蛋白一般在咽一肠腔表达的,编码该蛋白的基因有a、b两种基因型;另外,有38个克隆子与人畜共患寄生虫布氏锥体虫(Trypanosomabrucei)的假定蛋白相关,有12个克隆子与肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae)的唾液腺苷酶同源,有5个克隆子与质粒pKILl98的细胞毒性蛋白相关,该蛋白是由基因ccdB编码的;其它的克隆的功能有与毒性蛋白相关的,也有与宿主组织破坏有关,或在其寄生策略中起作用的,同时,还有大部分假定寄生基因编码的蛋白功能是未知的。SSH技术是一种有效的寄生基因分离方法,其在本研究中的食道腺寄生基因克隆上起了重要的作用;同时,本实验通过爪哇根结线虫寄生的不同阶段第一次分离了其咽腺特异表达的寄生相关基因,并获得一个含有69个假定寄生基因的分布图。本文研究结果为进一步理解爪哇根结线虫寄生侵染作用打下重要基础。
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