古菌Haloferax mediterranii AS2087是一株分离自地中海的嗜盐古菌。到目前为止，该菌是现在已知所有古菌中积累聚羟基脂肪酸酯(Polyhydroxyalkanoates，PHA)能力最强的一株古菌。而聚羟基脂肪酸酯是一类由多种细菌和古菌在营养不均衡生长条件下合成的一种胞内聚酯，在菌体内主要作为碳源和能源的储藏物质。本论文通过第二代测序技术-454测序方法对该菌进行全基因组测序拼接工作，得到了全基因组序列。并通过各种分析工具对其进行注释分析工作。　　 首先，对454测序方法所产生的庞大的数据进行了验证和筛选。去除重复、长度短和低质量的数据。其次，对剩下数据通过Phred-phrap-consed等软件及实验进行拼接。最后，对拼接后的序列进行了双盲实验验证。　　 随后，在得到全基因组序列的基础上本论文通过NCBI、BLAST、COG、KEGG、tRNA-scan等生物信息学分析工具及网站对基因组序列进行了分析注释工作。得到了tRNA、rRNA、ORF等基本信息并获得其序列及基因组GC含量等参数。同时本论文还将Haloferax mediterranii AS2087与目前已知的具有全基因组序列的其他6株嗜盐古菌进行了比较基因组分析，尤其在Clustered regularlyinterspaced short palindromic repeats(CRISPR)方面作了较详细的分析，并在leader序列中发现了较保守的回文结构。在PHA方面初步研究了PHA合成中重要的丙酰辅酶A的合成代谢途径。　　 本论文的研究工作为嗜盐古菌的研究提供了又一株具有全基因组序列的菌株，并提供了相关的注释信息。