嗜盐古菌是一类生活在高盐环境中的古细菌。氯视紫红质蛋白(halorhodopsin，HR)是其细胞膜上的蛋白质，它具有典型的七次跨膜结构和光驱动阴离子泵功能，对它的研究具有重要的理论价值。本文对嗜盐古菌的分子系统分类学，HR蛋白结构、功能和古视紫红质蛋白家族基因演化进行了概述。工作内容主要包括新疆地区嗜盐古菌分子系统分类学研究、hop核心序列的获取与分析、bop与hop基因演化。 采用PCR方法获得了AB19、AB30和AJ5编码螺旋C至螺旋G的HR蛋白基因片断以及AB19的编码螺旋C至螺旋GBR蛋白基因片断和16SrRNA基因，并测定了基因的核苷酸序列。翻译出的氨基酸序列与已报道的相应片断进行对比，三个HR蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列与其它菌株差异显著。基于BR和HR蛋白螺旋C到G片断和16SrDNA序列的同源性比较及系统发育学研究表明，AB19、AB30分别是Haloarcula、Haloterrigena属中的新成员。获得的AJ5HR蛋白序列在Halobiforma属中尚属首次。菌株AB19的16SrDNA、hop和bop核心序列已被GenBank数据库收录，其序列号分别为DQ471854、DQ471855和DQ352132。