逻辑悖论研究是一个涉及多学科的边缘性、交叉性研究领域。当代逻辑悖论研究已经明确指认了逻辑悖论的语用学性质,明晰划分了逻辑悖论研究的不同层面,即“特定领域某个或某组悖论具体解悖方案研究”、“各种悖论及解悖方案的哲学研究”,以及“一般意义的解悖方法论研究”。历经两千多年,尤其是近百年以来,逻辑悖论研究的前两个层面取得了丰富成果、获得了长足发展。基于逻辑悖论研究的既有成果,凭藉悖论方法论的理论平台,本文以科学理论创新为切入点,深入探讨了逻辑悖论在科学理论创新中的作用机理,对相对薄弱的逻辑悖论研究的第三个层面作了拓展性探究。　　科学理论创新是科学方法论关注的核心问题。本文第一章首先回顾了古典理性论和经验论、逻辑主义、历史主义关于科学理论创新的经典学说,继而对科学理论创新研究的当代趋向,特别是社会建构论和科学修辞学所研究的主要问题作了跟踪梳理。通过对既有科学理论创新研究成果的批判性审视,阐明逻辑相容性是科学理论的基本特质,而逻辑悖论的出现则是科学理论的根本性“反常”。在溯述悖论发展史实的基础上,表明了逻辑悖论研究在策动科学理论创新方面所具有的重要作用。　　本文第二章、第三章和第四章,依据科学理论的发生、发展的内在逻辑,系统地探究科学理论中逻辑悖论生成的原因、机制、存在状态及其消解对科学理论所带来的革命性变革,进而彰显了逻辑悖论在科学理论创新中的作用机理。　　第二章首先对学界关于悖论生成原因的诸多探讨进行了归纳评述。鉴于任何悖论总是相对于一定的知识系统而成立,而科学理论本身正是一种精致化的知识系统,同时,从语用学角度论,任何科学理论中悖论的出现都与特定领域的认知共同体“公认正确的背景知识”相关联,文章从知识论层面探讨了科学理论悖论形成的原因,表明对零散的知识点具有“自组织”功能的基本信念是多元的、不确定的,这是在知识系统内生成逻辑矛盾乃至悖论的根源。由此,文章从科学理论认识发生学和从科学理论的构造方法角度,进一步论证了如下观点:具备一定复杂度的科学理论无法彻底拒斥悖论。　　第三章首先剖析了科学理论悖论生成的表征与一般机理。文章指出,从清理逻辑矛盾的维度看,科学理论中的悖论往往是在造成普通“反常”的一般逻辑矛盾被不断清理后,出现了用清理普通逻辑矛盾的方式无法予以解决的特殊逻辑矛盾之际;从科学理论的适用范围维度看,悖论往往生发于科学理论作“推广性”和“统一性”研究的过程之中;从真值维度看,悖论往往生成于认知主体对其背景知识中的命题由“似真”置信到确信为“真”的推进性认识中,它使得认知主体的“优先策略”失效,进而陷入对矛盾性的论断难以作出取舍抉择的“悖态”之中。由于存在悖论的科学理论是在逻辑上乏相容的理论,在没有更好的相容性理论可取而代之时,作为认知策略,可以通过特定的隔离方式“圈禁”矛盾,使之不能任意扩散而毁坏整个理论系统,以保持其在适当范围内应有的功用。这种实践的需求与亚相容逻辑所欲刻画的理论状态相吻合。文章认为,可以运用亚相容逻辑对处于“悖态”中的理论进行逻辑刻画。　　第四章梳理了悖论之“解决”的一般标准的讨论,认同RZH解悖标准,并对一些重要的解悖案例作了评述,在此基础上,将RZH解悖标准应用到具体科学理论悖论的解决之中。由于具体科学理论悖论的解决需要科学共同体改变其“背景知识”中的基本信念或基础概念,亦即需要扬弃原有理论的“硬核”,并由之而生发新理论,这就充分凸现了逻辑悖论在科学理论创新中的“杠杆”性功用。　　在揭示逻辑悖论在科学理论创新中的作用机理的基础上,本文第五章对悖论研究中的具体方法作了概括与总结,并对悖论方法论在演绎科学和自然科学以及社会科学、哲学中的重要的应用价值分别作了概括和解析,展望了更加广泛的悖论方法论研究与应用的发展方向。